Le conseil d’administration est composé de membres élus parmi les 3 collèges de l’AREC. Il pilote le projet associatif et les grandes orientations de l’agence.
Il gère les décisions courantes de l’agence et est composé de membres élus par le conseil d’administration du 30 mai 2022.
L’AREC est principalement financée par la direction régionale Nouvelle-Aquitaine de l’ADEME et le Conseil Régional Nouvelle-Aquitaine.
L’AREC est membre du RARE, le Réseau national des Agences Régionales de l’Energie et de l’Environnement. Créé en 1995, il regroupe 13 agences qui interviennent, à l’échelle des régions et auprès des acteurs locaux, pour favoriser la prise en compte de la protection de l’environnement et la mise en œuvre d’un développement durable. L’AREC occupe la fonction de Trésorier au sein du Bureau du RARE.